Муто Кадзуки — обычный ученик старших классов школы. Как-то раз он видит сон, в котором его он, защищая некую незнакомку, погибает от рук монстра. Через некоторое время этот кошмарный сон становится реальностью — змееподобный монстр нападает на Муто и его сестру. Цумура Токико — девушка, которая ему приснилась, рассказывает, что этот монстр называется гомункул. после этого Кадзуки подвергается нападению монстра. Кадзуки в это время защищал Токико. В результате монстр убивает юношу, но таинственная незнакомка Цумура воскрешает его при помощи Какугаа. Какуган — алхимическое приспособление, которое наделяет силами для борьбы с гомункулами. Благодаря этому, Кадзуки делает себе очень большое оружие, которое своим видом напоминает копье. Кадзуки вместе с Токико предстоят многочисленные схватки с гомункулами, а также их предводителем.